Bioxm中文版是一款基于Windows操作系统的基因序列分析软件,专为核酸序列分析而开发。该软件由南京农业大学的学生研究团队开发。它具有丰富的功能,主要用于常规DNA序列数据的分析,包括ORF查找、序列格式化、翻译、限制酶切位点分析、引物辅助设计、两个序列的Blast比较等。
软件特色
1、酶切位点分析输入序列之后,依次打开:序列分析>酶切位点分析,最后 点"开始分析"
2、DNA 统计分析
除了分析A、G、C、T、N的组成之外,还可以分析GC%的变化趋势。
3、序列比较
BioXM提供了两个序列比较的BLAST本地工具:
依次打开:序列分析>两个序列BLAST联配,依次选择序列比较的类型,输入序列后开始比较
常见问题
1、输入DNA序列BioXM似乎不能正确识别?答: 这是因为BioXM默认打开的是氨基酸序列,您可以在菜单中选择“序列整理”命令。
2、序列窗口中的序列容易混淆,怎么办?
答: 鼠标双击序列窗口可以更改序列标签名,使您不会混淆各窗口。
3、每次输入DNA序列总是保留其他非法序列怎么办?
答: 您可以在选项中打开强制识别序列为DNA,这样就会祛除其他非法序列。但是如果您要打开氨基酸序列,必须关闭此项目。
4、如何才能快速了解新版本BioXM的特色?
答: 打开帮助>更新记录>可以使您快速了解新版本BioXM的特色。
5、我想编辑序列,该如何做?
答: 如果您要编辑序列或更改序列颜色,可以关闭工具栏中的“是否允许序列自动格式化”图标。
6、查找SSR时好象有所遗漏?
答: 其实这并不是BioXM的错误,考虑到相近的SSR有可能是相同的(至少非常相似),我们设置了两个重叠SSR之间的距离,将其设置的小一些可能会出现更多的彼此靠近的SSR。
7、我运行BioXM总是忘记了时间怎么办?
答: 不要紧,您可以在选项中打开“提醒打开BioXM时间”选项卡,这样每过1个小时,BioXM就会自动提醒您。
8、窗口数目太少,怎么办?
答: 在工具>选项>序列窗口>中可以更改窗口出现的数目和背景色。